5 software de cariotipo automatizado para mapear tus cromosomas

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El cariotipo es el proceso de ordenar y emparejar todos los cromosomas que se encuentran en un organismo con el fin de obtener una visión global de todo el "mapa" de cromosomas de un individuo.

Pero primero asegurémonos de entender qué son los cromosomas. Los cromosomas son estructuras que se parecen a las hebras que están contenidas dentro del núcleo de cada una de las células de su cuerpo.

Cada estructura cromosómica contiene todo el plan de información genética de su cuerpo. Esto determina la forma en que tu cuerpo está estructurado, reacciona a los estímulos, predisposición a las enfermedades, etc. Las mujeres tienen 2 cromosomas 'X', y los hombres tienen un cromosoma 'X' y uno 'Y'. Cada célula de su cuerpo contiene 23 pares de cromosomas, 46 cromosomas en total.

Para que los investigadores puedan comprender las secuencias de cromosomas de cada paciente, utilizan el software de cariotipo . Este tipo de software está diseñado para realizar análisis de cromosomas y evalúa la estructura y el número de cromosomas de una persona. Al hacer esto, los investigadores y los científicos pueden detectar anomalías.

En este artículo, exploraremos algunas excelentes opciones de software que le permiten realizar un análisis de cariotipo.

Las 5 mejores herramientas de cariotipo automatizadas para usar en 2019

1

ArgusSoft

ArgusSoft es una excelente opción de software que le permite karyotype cromosomas humanos automáticamente por la posición de la banda, y también se puede utilizar para el cariotipo de animales y cromosomas de plantas en línea.

Características clave:

  • Tinción G, Q, R
  • Cariotipo automatizado de cromosomas humanos con reconocimiento de curvas.
  • Cariotipo automatizado de cromosomas porcinos.
  • 3 bases incorporadas de ideogramas estándar de cromosomas humanos con varios niveles de claridad: 400, 550 y 850 niveles
  • Puede agregar bases de ideogramas de cromosomas estándar para otras especies animales y vegetales
  • Métodos de preparación de muestras.
  • Entrada de imágenes de la placa metafásica usando una cámara y un escáner
  • Acompañando una imagen con gráficos.
  • División automatizada de cromosomas aplicados y en contacto.
  • Comparación de cromosomas e ideogramas.

También puede usar ArgusSoft para entrenar el sistema de reconocimiento de cromosomas usando preparaciones preestablecidas, puede transferir imágenes de la metafase y los cariogramas en la base de datos incorporada, puede producir patrones de informes, corregir cariotogramas y también almacenar e imprimir imágenes y resultados de análisis.

Puede obtener capacitación y soporte para usar ArgusSoft desde su sitio web oficial. El centro de soporte incluye capacitación, mantenimiento y servicios de consultoría.

Prueba ArgusSoft

2

HiBand de Applied Spectral Imaging

HiBand es un software creado por Applied Spectral Imaging, que puede realizar análisis de cromosomas avanzados mediante el uso de funciones de cariotipo digital. Este software

utiliza las funciones de escaneo automático para un análisis en profundidad de la estructura del cromosoma.

Puede utilizar la amplia gama de funciones que se encuentran en HiBand para indexar, contar, almacenar y administrar datos de resultados. También puede usar este poderoso software para escanear la secuencia de cromosomas automáticamente.

Los resultados obtenidos mediante el uso de las funciones de cariotipo encontradas en HiBand se pueden almacenar en una ubicación segura con capas cifradas y protegidas por contraseña. Esto le brinda tranquilidad con respecto a la pérdida de cualquier dato de secuenciación importante, y debido a esto, también mejora la eficiencia de su laboratorio.

La clasificación de los resultados se realiza de una manera muy sencilla, solo tiene que buscar la secuencia específica de cromosomas, y todos los resultados se muestran en una pantalla bien contenida que ofrece acceso fácil para modificar, revisar y también agregar etiquetas a cualquier de los archivos.

Características clave:

  • Brightfield Karyotyping-G-Band y R-Band
  • Cariotipo de fluorescencia-Q-Band, R-Band y FISH
  • Cariotipo espectral
  • Conteo automático de cromosomas.
  • Indización y clasificación de cromosomas
  • Separación avanzada de cromosomas y mejora de imagen avanzada
  • Galería de imágenes: puede presentar todas las metafases de los casos y los cariotipos en una pantalla
  • Puede comparar los cromosomas - verlos de lado a lado.
  • Ideograma Abberante: puede agregar cromosomas, células, ideogramas y anotaciones en un generador de imágenes

HiBand utiliza flujos de trabajo totalmente automatizados para aumentar la eficiencia del laboratorio, tiene funciones de escaneo de 'inicio y alejamiento', encuentra metafases, lee códigos de barras automáticamente, carga imágenes en tiempo real durante el escaneo de diapositivas y también exporta al laboratorio LIS Central Portal y Base de datos.

Prueba HiBand

3

Ikaros por MetaSystems

Este sistema de cariotipo tiene una interfaz de usuario muy intuitiva que ofrece todas las funciones en una pantalla. Esto permite un acceso fácil y rápido a toda la información obtenida.

Ikaros se puede usar con Neon, que es una plataforma diseñada para ayudar con los datos de imagen y la organización de casos. Neon recopila datos de todos los trabajos de creación de imágenes, fuentes externas y le permite presentarlos de una manera fácil de entender utilizando un panel de administración de casos.

Esta herramienta le permite tener siempre información importante a mano y almacenada de manera segura, pero utiliza algoritmos de administración de datos muy sólidos, tiene una buena variedad de formas de observar datos y puede proporcionar búsquedas específicas basadas en palabras clave y características de los datos.

Echa un vistazo a más información sobre Neon y sus características aquí .

Ikaros es compatible con muchas técnicas de bandas diferentes: Brightfield G-Band y R-Band, Fluorescence Q-Band, R-Band y FISH: ofrece una gran cantidad de formas de cariogramas predefinidas para humanos, plantas y animales. Puede editar fácilmente estos formularios para agregar los datos necesarios para el tipo de investigación que está realizando.

El hecho de poder comparar los cromosomas por clases o por cariogramas, le ofrece información muy útil que le permite identificar fácilmente las diferencias.

Prueba Ikaros

4

MetaClass de Microptic

MetaClass es un excelente software de cariotipo diseñado de forma modular. Este software le ayuda a realizar estudios de cariotipo y FISH de cromosomas.

MetaClass está formado por los siguientes módulos:

  • Base de datos MetaClass

Base de datos que se puede instalar con cualquiera de los módulos de MetaClass. Le permite almacenar los detalles del paciente y le brinda acceso fácil a los resultados. Puede crear informes personalizados en cualquier idioma con este módulo.

  • MetaClass Karyotyping

Le permite estudiar un cariotipo después de que las imágenes de la etapa de preparación de la metafase se hayan capturado digitalmente, y organizarlas en pares según el tamaño, la posición, etc. Este módulo le brinda resultados de excelente calidad cuando se trata de bandas cromosómicas, y también puede Proporcionarle informes de aspecto profesional.

Las características clave incluyen:

  • El estudio del cariotipo se analiza con magnificación de campo claro 100X.
  • Puede capturar varias imágenes en metafase.
  • La calidad de imagen es modificable para resultados más nítidos
  • Clasificación automática de cromosomas.
  • 4 vistas de pantalla: ventana de cromosomas Metaphase, Karyotype y Unclassified
  • Puede mostrar prototipos de cromosomas
  • Los cromosomas que no están clasificados se pueden corregir de forma automática o manual: superposiciones, separaciones, cruces, rotaciones, etc.
  • Los archivos de sesión MTC o las imágenes BMP se pueden guardar y volver a cargar en cualquier momento
  • Puede exportar cromosomas individuales a la base de datos Metaclass con la posibilidad de agregar comentarios y notas

Aquí hay un ejemplo de un informe de cariotipo de Metaclass.

  • MetaClass FISH

Este es un módulo de análisis que le permite obtener una imagen de Hibridación Fluorescente IN SITU (FISH). Este módulo captura imágenes mediante sondas de ADN fluorescentes y le permite confirmar anomalías genéticas: trisomías, mocrodelecciones, reordenamientos de cromosomas, etc.

Las imágenes FISH se analizan con un aumento de 100X y, para un rango más amplio de claridad de imagen, también pueden capturar imágenes con diferentes filtros.

Si está interesado en obtener más información sobre los módulos presentados anteriormente y otras características, puede echar un vistazo a través del catálogo de MetaClass.

Si es un tipo curioso y desea ver un informe obtenido mediante el método FISH, puede

un archivo PDF de muestra.

Prueba MetaClass

5

GenASis Bandview

GenASis Bandview es otro gran software de cariotipo que se construye a partir de módulos con diferentes capacidades. Puede utilizar esta aplicación para realizar diagnósticos de cariotipo y obtener resultados de prueba precisos.

Este software le permite personalizar completamente el flujo de trabajo y el proceso de diagnóstico, según las necesidades de su empresa y los objetivos que está tratando de alcanzar.

La amplia gama de herramientas provistas en BandView son fácilmente accesibles con solo un clic del mouse, y ofrece una poderosa experiencia de cariotipo G / R / C / Q-Band. Puede elegir entre un flujo de trabajo automatizado o manual cuando se trata de localizar metafases y capturar imágenes.

Las anomalías cromosómicas, si se encuentran, se pueden observar mediante la adición, la eliminación o la reorganización del material genético del paciente. Con BandView, puede utilizar la banda de la técnica molecular FISH.

FISH utiliza sondas fluorescentes para unirse a diferentes partes del cromosoma, lo que permite que el software detecte y localice las anomalías encontradas en secuencias específicas de ADN.

Prueba GenASis Bandview

Conclusión

En este artículo, exploramos algunos de los mejores programas de cariotipo automatizado que existen en el mercado a finales de 2018.

Las opciones de software de cariotipo cubiertas en este artículo le ofrecen una variedad de características que lo ayudarán a alcanzar los objetivos de su empresa.

Al usar este tipo de software, puede contar miles de estructuras de cromosomas rápidamente, analizar con diferentes técnicas profesionales y producir informes de alto grado que le permitirán identificar cualquier anomalía con facilidad.

Nos encantaría conocer su opinión sobre el software que presentamos en esta lista de los 5 principales. Por favor, no dude en hacérnoslo saber usando la sección de comentarios a continuación.

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